工程学院是在我校1912年成立时所设渔机科基础上发展而成的传统特色学院。

工程学院是海洋大学整体实力雄厚的学院之一，拥有一支结构合理、年富力强、学术思想活跃、综合素质好的优秀学术队伍。现有教职工52人，具有高级职称的教师14人，硕士生导师12人，有博士学位的14人，有硕士学位的17人。学院下设学院办公室、学生工作办公室、机电工程系、工业工程系、电气工程系、综合实验中心等机构，其中机电工程系由机电工程、基础教学、轮机工程三个教研室组成，工业工程系下设工业工程教研室，电气工程系下设电工电子和电气自动化教研室。现有机械设计制造及其自动化、工业工程和电气工程及自动化三个本科专业，轮机工程专科专业，拥有“机械设计及理论”专业硕士学位和“机械工程”工程硕士授予权，为了培养学生的创新能力和发展海洋科技，成立了渔业节能研究所、生物机电工程中心、机电与海洋工程技术研究中心和大学生科技活动中心。

工程学院具有较强的科研实力，拥有较宽的研究领域和良好的科研基础，主要研究方向涉及现代制造技术、物流装备及技术、现代农业和渔业装备及相关控制技术、机电一体化技术、CAD/CAE/CAM/PDM、电子与电气工程技术等。以上研究方向依托生命、海洋、食品和渔业经济、渔业管理等优势学科和重点学科，不仅对具有我校特色的生命科学与技术学院、海洋学院、食品学院等相关专业、学科起到重要的支撑作用，同时工程学科的发展也可借助我校相关学院的现有资源，实现资源互补和共享，使学科发展相互支持，共同发展，通过跨学科联合设置本科专业，使我校可能出现新专业或研究方向。

机械工程学科主要从事机械工程及自动化、机械设计及理论的研究。主要任务是将传统的机械工程装备实现自动化，并且应用到机械装备食品加工机械，环保处理系统（水）的革新、开发研究等工作。机械工程及自动化学科主要是对自动控制原理、数字控制、机械工程装备的自动化、智能化等方面的研究工作。机械设计及理论学科主要是对机械进行功能综合并定量描述；以及控制其性能的基础技术科学，它的主要任务是把多种知识、信息注入设计、加工成机械制造系统能接受的信息并输入机械制造系统。

根据我校发展状况，工程学院定位于：培养基础理论扎实，知识面宽，实践能力强，面向工程实际，掌握机电一体化和机械制造及其自动化理论及技术的应用型高级工程技术人才。根据毕业生就业单位的跟踪问卷调查，各单位对毕业生在单位的敬业精神、理论基础和专业知识、实践能力、创新精神、组织协调与管理能力、团队合作意识、综合素质与能力、能否胜任自己的工作都持肯定态度，满意率基本上都在95％以上，这些毕业生在工作岗位上兢兢业业，深获好评。

工程学院目前工作的重点是：以先进制造技术为核心，以国家和上海发展海洋战略为依托，围绕海洋工程、物流工程和生物机电工程进行专业、学科建设、人才培养和科学研究，不断提高办学效率及水平。培养德智体全面发展的合格人才。同时积极拓展对外交流，提高总体实力，争取到2012年，形成专业布局与课程体系较为合理的、有重点学科相匹配的、在上海地区和国内有重要影响的优势与特色专业。